Arima Genomics引领三维基因组学进入临床新时代

2025年6月，美国三维基因组学平台企业Arima Genomics宣布完成由Illumina Ventures领投的2200万美元C轮融资。此轮融资将主要用于推出“专注临床检测的管线”，旨在通过测序方法确定3D基因组结构，如基因融合和重排。

作为聚焦基因组学和精准医疗的风投公司，Illumina Ventures依托全球基因测序巨头Illumina的战略合作关系，将科学和技术开发成市场领先的公司。此次领投不仅旨在加码三维基因组学、空间组学与结构变异检测等前沿应用，还任命前Illumina高管Tom Willis博士为CEO，进一步强化肿瘤结构变异检测战略。

这笔融资传递出一个明确趋势：继空间转录组、单细胞测序后，三维基因组（3D Genomics）正逐步成为基础科研与精准医疗的新焦点。

Arima Genomics通过“标准化试剂盒 + 模块化分析流程”的路径，推动Hi-C等复杂技术的商业化，试图打破实验室限制，将三维基因组带入可规模应用、可商业化的科研与临床实践中。

一个样本改变一家公司：从科研走向临床一线

Arima成立于2015年，最初专注于开发标准化工具，帮助科研人员解析DNA的三维折叠结构。转折点发生在2022年，一份来自胶质母细胞瘤患者的活检样本被送至Arima，其团队通过三维基因组平台识别出传统方法遗漏的结构重排，为患者制定新治疗方案并取得积极疗效。

这次经历使Arima意识到，仅凭线性序列难以捕捉隐藏于三维结构中的致病变异，而这正是精准治疗的关键。从那以后，Arima不再局限于科研服务，而是开始涉猎临床检测场景，为每位患者还原“完整”的基因组图谱。

技术的意义不仅在于论文，更在于能改变患者命运的报告。这种文化推动Arima从工具开发者、试剂盒供应商转型为空间组学平台型企业。其融资不仅支撑了产品线扩展，更预示其迈向临床场景的野心。

Arima的融资节奏不仅支撑了产品线的持续扩展，更预示着其迈向临床场景的野心。在2022年完成700万美元B轮融资后，公司加入美国脑计划，涉足神经系统的空间组学研究，并与精准肿瘤诊断公司Protean共建Aventa Genomics实验室。同年10月，Aventa推出FusionPlus产品，支持FFPE肿瘤样本的融合基因检测。

多产品矩阵：一套试剂盒打造空间组学多元工具库

DNA在细胞核里并非平铺，而是盘绕折叠。这种三维结构影响哪些基因被打开或关闭，决定细胞功能表现。三维基因组学正是研究这种染色质折叠的科学。

Arima的产品体系不仅是一系列试剂盒组合，更是围绕Hi-C技术打造的完整工具平台。产品包括研究级产品、临床服务与生物信息服务三大模块，覆盖染色质互作、结构变异、病毒整合等多样应用。

把实验装进“盒子”：Hi-C建库的标准化起点

Arima的明星产品Arima-HiC+将传统Hi-C实验中耗时、易错的步骤模块化、预配好，使研究人员可以像做一次RNA-seq一样快速获取结果。这首次使“只属于顶尖实验室”的三维基因组图谱具备“可复制、可批量”的可能性。

随着样本类型拓展，Arima推出适配临床石蜡包埋组织的版本——Arima-HiC+ FFPE。同时提供Promoter Capture Hi-C和Custom Capture Hi-C方案，定向捕获特定区域以深入研究基因调控逻辑与靶点识别。

服务临床：为病理样本构建空间分子视角

通过CLIA认证的Aventa临床检测实验室提供结构变异检测服务Aventa。这类服务广泛用于药企早期临床研究、精准用药辅助决策。

外包与集成服务：让空间组学成为人人可用的工具

对于尚不具备实验条件或希望快速启动研究的用户，Arima提供“交钥匙式”外包服务。用户只需提交样本，其余流程由Arima负责并交付结果。

当三维基因组进入临床

随着产品性能优化，Arima所代表的3D Genomics技术正从科研走向真实世界。在肿瘤诊断、基因编辑安全性评估等场景中成为基因调控机制与疾病变异研究的“关联桥梁”。

中国三维基因组的工程化正迎来发展窗口期

近年来，中国企业在三维基因组领域稳步探索。例如，诺禾致源提供结合Hi‑C与长读长测序的服务；安诺基因则将Hi‑C纳入科研服务体系。这些实践推动中国空间组学从科研服务迈向精准医疗应用研究。

Arima的发展路径为中国企业提供三点借鉴：通过产品工程化思维打通技术落地；聚焦高临床价值场景；以“平台+合作”模式拓展商业边界。